يلجأ العديد من الناس إلى استخدام جهاز الميكروويف لتسخين الطعام كونه يوفر لهم الوقت و المجهود و لكن لا يخلو هذا الجهاز من المخاطر الصحية ، لذلك يجب اتباع بعض الإرشادات قبل استخدامه . فجهاز الميكروويف يعد حلاً سريعاً لتسخين الأطعمة و لكن هناك دائماً جدل حول ما إذا كان لاستخدام الميكروويف ضرر صحي . و قد حدد الخبراء تلك المخاطر فبشكل عام لا يجب اللجوء للميكروويف لتسخين كل شيء ، فتسخين البيض مع قشرته قد ينفجر في الميكروويف بسبب ضغط البخار ، كما أن الحرارة الصادرة من الميكروويف تتفاعل مع الفلفل الحار أثناء تسخينه و تؤدي إلى تشكيل مادة قد تحرق العيون و الحلق . كما أن تسخين الأكل في الميكروويف قد يؤثر على جودته و قيمته الغذائية فيجب الامتناع عن تسخين الطعام في الأواني المغلقة كالزجاج و يجب فتحها قبل وضعها داخل هذا الفرن ، إضافة إلى عدم وضع أدوات معدنية كالملعقة أثناء التسخين . و يجب عدم تسخين الأطعمة في أوعية بلاستيكية أو المغطاة بأغطية بلاستيكية فعند تسخين هذه الأطعمة في الميكروويف تتكون مواد كيمياوية ضارة من البلاستيك و تتفاعل مع الأطعمة ما قد يسبب العديد من الأمراض و في مقدمتها السرطان . و ينصح الخبراء بعدم استخدام الأواني المعدنية و رقائق الألمنيوم لطهي و تسخين الأطعمة داخل الميكروويف حيث من الممكن أن يسبب ذلك حريقا داخل هذا الفرن .